Os sindicatos patronais da indústria são a base da Federação. O Sistema FIEB conta hoje com 40 sindicatos patronais filiados, que representam mais de 1.566 empresas de vários segmentos industriais. Juntas essas empresas respondem por cerca de 90% da indústria de transformação da Bahia e 85% das exportações do estado. A atual gestão do Sistema FIEB acredita que o desenvolvimento dos setores produtivos está vinculado a sindicatos estruturados e capazes de trabalhar projetos adequados para alcançar este objetivo. Nesse sentido, vem ampliando a sinergia com as representações oficiais dos diversos segmentos industriais baianos.